Весь регион, охватывающий Аризону и Колорадо, в юрском периоде когда-то был огромной пустыней с песчаными дюнами. Со временем песчаные дюны начали образовывать слои, состоящие из песка, ила и гравия, и затвердевать. Эти отложения со временем превратились в песчаник Навахо, который является осадочной породой и образует стены каньонов, которые мы видим сегодня. Насыщенный цвет и различные оттенки красного и оранжевого, которые можно увидеть на стенах, вызваны окислением железа в горных породах с течением времени. Следующий этап формирования Antelope Canyon начался с поднятия плато Колорадо, что привело к ливневым паводкам, эрозии и, в конечном итоге, к образованию щелевого каньона.